Illumina公布新一代测序仪发展大计

近日，Illumina公司公布了其新一代测序仪Genome Analyzer系统的发展路线，计划在2009年实现每次运行获得超过95 GB的高质量数据。该路线勾勒出试剂、算法和硬件的升级，将会显著改善准确率、读长、数据密度和易用性。Illumina预计今年底单个流动室能产生人类基因组的25倍覆盖度，而人类基因组的测序费用降低至1万美元以下。
以Genome Analyzer现在的配置，每次运行能产生15 GB以上的高质量数据。以此为基础， 2009年Genome Analyzer的性能会提升6倍以上。这些改进将分几个阶段进行，并包括以下元素：
• 试剂改良，包括使用全新的聚合酶，让运行速度更快，配对片断超过2×100 bp。这些改进有望提高测序准确性，实现2×100配对末端阅读片断的准确性超过98.5%，2×50 配对末端片断则超过99.9%。
• 硬件升级，包括流动室支架改进和试剂冷却器增容，不仅能增加产量，还能实现至少100个循环的无人值守自动化。这些硬件将组成Genome Analyzer 升级试剂盒，现在的用户也能立即订购，享受升级的乐趣。
• 算法改进，包括检测簇的新方法，将让高密度流动室的产量提高80%，并改善碱基检出的准确性。
• 数据密度增加，通过利用1微米及亚微米特征的半有序阵列。这些有序的阵列，以及读长的增加，有望在每次运行中分别产生55和95 GB的数据。
这些改进不仅增加了Genome Analyzer的产量，降低了测序费用，还大大扩展了它的应用空间。Illumina生命科学部的副总裁Joel McComb表示：“作为应用最广的新一代测序平台，Genome Analyzer已发表论文200多篇，并让世界各地的科学家快速经济地进行突破性的研究。经过2009年的系统升级，我们预计Genome Analyzer将继续成为众多应用中的灵活工具，包括大规模全基因组分析、从头测序、宏基因组学等，并将加快人类健康、生物多样性和环境的探索速度。” >